Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms