Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP9O43818 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP9O43818 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP9O43818 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP9O43818 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP9O43818 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP9O43818 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP9O43818 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP9O43818 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP9O43818 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP9O43818 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP9O43818 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRP9O43818 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRP9O43818 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRP9O43818 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRP9O43818 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRP9O43818 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRP9O43818 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRP9O43818 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRP9O43818 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRP9O43818 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRP9O43818 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RRP9O43818 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRP9O43818 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRP9O43818 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRP9O43818 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRP9O43818 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRP9O43818 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRP9O43818 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRP9O43818 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRP9O43818 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRP9O43818 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRP9O43818 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRP9O43818 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRP9O43818 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRP9O43818 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRP9O43818 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRP9O43818 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRP9O43818 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRP9O43818 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRP9O43818 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRP9O43818 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRP9O43818 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRP9O43818 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRP9O43818 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRP9O43818 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRP9O43818 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRP9O43818 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRP9O43818 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRP9O43818 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RRP9O43818 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RRP9O43818 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RRP9O43818 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RRP9O43818 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RRP9O43818 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RRP9O43818 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RRP9O43818 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRP9O43818 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRP9O43818 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRP9O43818 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRP9O43818 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRP9O43818 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRP9O43818 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRP9O43818 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRP9O43818 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RRP9O43818 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRP9O43818 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRP9O43818 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRP9O43818 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRP9O43818 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRP9O43818 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRP9O43818 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRP9O43818 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRP9O43818 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRP9O43818 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRP9O43818 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRP9O43818 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRP9O43818 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRP9O43818 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRP9O43818 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRP9O43818 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRP9O43818 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRP9O43818 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRP9O43818 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRP9O43818 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRP9O43818 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRP9O43818 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRP9O43818 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRP9O43818 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRP9O43818 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRP9O43818 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRP9O43818 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRP9O43818 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRP9O43818 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRP9O43818 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRP9O43818 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRP9O43818 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRP9O43818 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRP9O43818 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRP9O43818 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms