Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGTAO43765 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGTAO43765 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGTAO43765 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGTAO43765 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGTAO43765 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGTAO43765 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGTAO43765 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGTAO43765 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGTAO43765 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGTAO43765 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGTAO43765 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGTAO43765 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGTAO43765 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGTAO43765 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGTAO43765 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGTAO43765 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGTAO43765 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGTAO43765 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGTAO43765 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGTAO43765 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGTAO43765 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGTAO43765 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SGTAO43765 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGTAO43765 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGTAO43765 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGTAO43765 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGTAO43765 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGTAO43765 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGTAO43765 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGTAO43765 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGTAO43765 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGTAO43765 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGTAO43765 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGTAO43765 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGTAO43765 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGTAO43765 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGTAO43765 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGTAO43765 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGTAO43765 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SGTAO43765 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SGTAO43765 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGTAO43765 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGTAO43765 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGTAO43765 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGTAO43765 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGTAO43765 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SGTAO43765 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGTAO43765 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGTAO43765 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGTAO43765 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGTAO43765 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGTAO43765 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGTAO43765 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGTAO43765 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGTAO43765 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGTAO43765 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGTAO43765 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGTAO43765 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGTAO43765 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGTAO43765 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGTAO43765 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGTAO43765 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGTAO43765 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGTAO43765 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGTAO43765 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGTAO43765 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGTAO43765 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGTAO43765 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGTAO43765 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGTAO43765 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGTAO43765 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGTAO43765 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGTAO43765 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGTAO43765 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGTAO43765 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SGTAO43765 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGTAO43765 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGTAO43765 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGTAO43765 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGTAO43765 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGTAO43765 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGTAO43765 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGTAO43765 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGTAO43765 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGTAO43765 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGTAO43765 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGTAO43765 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SGTAO43765 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGTAO43765 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGTAO43765 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGTAO43765 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGTAO43765 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGTAO43765 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGTAO43765 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGTAO43765 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGTAO43765 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGTAO43765 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGTAO43765 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGTAO43765 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms