Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRKAB2O43741 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKAB2O43741 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms