Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
KDELR3O43731 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KDELR3O43731 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms