Protein–RNA interactions for Protein: O43474

KLF4, Krueppel-like factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF4O43474 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLF4O43474 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLF4O43474 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLF4O43474 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLF4O43474 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
KLF4O43474 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLF4O43474 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLF4O43474 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLF4O43474 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
KLF4O43474 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
KLF4O43474 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLF4O43474 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLF4O43474 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLF4O43474 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLF4O43474 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLF4O43474 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
KLF4O43474 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLF4O43474 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLF4O43474 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLF4O43474 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLF4O43474 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLF4O43474 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLF4O43474 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLF4O43474 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLF4O43474 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
KLF4O43474 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLF4O43474 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLF4O43474 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLF4O43474 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
KLF4O43474 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLF4O43474 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLF4O43474 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLF4O43474 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLF4O43474 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLF4O43474 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLF4O43474 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLF4O43474 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLF4O43474 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLF4O43474 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLF4O43474 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLF4O43474 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLF4O43474 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLF4O43474 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLF4O43474 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLF4O43474 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLF4O43474 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLF4O43474 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLF4O43474 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLF4O43474 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLF4O43474 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLF4O43474 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLF4O43474 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLF4O43474 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLF4O43474 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLF4O43474 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLF4O43474 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLF4O43474 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLF4O43474 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLF4O43474 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLF4O43474 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLF4O43474 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLF4O43474 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLF4O43474 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLF4O43474 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLF4O43474 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLF4O43474 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLF4O43474 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLF4O43474 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLF4O43474 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLF4O43474 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLF4O43474 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLF4O43474 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLF4O43474 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLF4O43474 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLF4O43474 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLF4O43474 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLF4O43474 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLF4O43474 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLF4O43474 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLF4O43474 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLF4O43474 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLF4O43474 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLF4O43474 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLF4O43474 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLF4O43474 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLF4O43474 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLF4O43474 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLF4O43474 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLF4O43474 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLF4O43474 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLF4O43474 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLF4O43474 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KLF4O43474 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLF4O43474 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KLF4O43474 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLF4O43474 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLF4O43474 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLF4O43474 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLF4O43474 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLF4O43474 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms