Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF3O43395 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF3O43395 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms