Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MTSS1O43312 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MTSS1O43312 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTSS1O43312 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms