Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPAA1O43292 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
GPAA1O43292 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPAA1O43292 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms