Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SIAH2O43255 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIAH2O43255 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIAH2O43255 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIAH2O43255 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIAH2O43255 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIAH2O43255 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIAH2O43255 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIAH2O43255 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIAH2O43255 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIAH2O43255 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIAH2O43255 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SIAH2O43255 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIAH2O43255 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIAH2O43255 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIAH2O43255 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIAH2O43255 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIAH2O43255 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIAH2O43255 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIAH2O43255 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SIAH2O43255 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SIAH2O43255 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIAH2O43255 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms