Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DYNC1LI2O43237 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DYNC1LI2O43237 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DYNC1LI2O43237 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms