Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SGSM2O43147 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SGSM2O43147 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SGSM2O43147 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SGSM2O43147 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SGSM2O43147 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SGSM2O43147 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SGSM2O43147 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SGSM2O43147 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SGSM2O43147 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SGSM2O43147 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SGSM2O43147 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SGSM2O43147 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SGSM2O43147 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SGSM2O43147 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SGSM2O43147 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SGSM2O43147 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SGSM2O43147 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SGSM2O43147 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SGSM2O43147 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SGSM2O43147 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SGSM2O43147 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SGSM2O43147 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SGSM2O43147 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SGSM2O43147 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SGSM2O43147 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms