Protein–RNA interactions for Protein: O15417

TNRC18, Trinucleotide repeat-containing gene 18 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC18O15417 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNRC18O15417 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNRC18O15417 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNRC18O15417 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNRC18O15417 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNRC18O15417 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNRC18O15417 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNRC18O15417 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNRC18O15417 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNRC18O15417 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNRC18O15417 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNRC18O15417 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNRC18O15417 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNRC18O15417 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNRC18O15417 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNRC18O15417 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNRC18O15417 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNRC18O15417 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNRC18O15417 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNRC18O15417 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNRC18O15417 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNRC18O15417 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNRC18O15417 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNRC18O15417 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNRC18O15417 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNRC18O15417 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNRC18O15417 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNRC18O15417 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNRC18O15417 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNRC18O15417 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TNRC18O15417 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNRC18O15417 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TNRC18O15417 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TNRC18O15417 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TNRC18O15417 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TNRC18O15417 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNRC18O15417 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNRC18O15417 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNRC18O15417 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNRC18O15417 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNRC18O15417 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNRC18O15417 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNRC18O15417 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNRC18O15417 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNRC18O15417 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TNRC18O15417 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNRC18O15417 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNRC18O15417 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNRC18O15417 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNRC18O15417 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNRC18O15417 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNRC18O15417 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNRC18O15417 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNRC18O15417 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNRC18O15417 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNRC18O15417 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNRC18O15417 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNRC18O15417 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
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