Protein–RNA interactions for Protein: O14777

NDC80, Kinetochore protein NDC80 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC80O14777 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDC80O14777 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDC80O14777 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDC80O14777 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NDC80O14777 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NDC80O14777 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDC80O14777 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDC80O14777 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDC80O14777 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDC80O14777 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDC80O14777 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDC80O14777 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDC80O14777 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDC80O14777 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NDC80O14777 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDC80O14777 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDC80O14777 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDC80O14777 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDC80O14777 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDC80O14777 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDC80O14777 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDC80O14777 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDC80O14777 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDC80O14777 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDC80O14777 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDC80O14777 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDC80O14777 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDC80O14777 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDC80O14777 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDC80O14777 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDC80O14777 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NDC80O14777 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDC80O14777 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDC80O14777 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NDC80O14777 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDC80O14777 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDC80O14777 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDC80O14777 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDC80O14777 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDC80O14777 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDC80O14777 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDC80O14777 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NDC80O14777 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDC80O14777 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDC80O14777 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDC80O14777 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDC80O14777 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDC80O14777 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDC80O14777 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDC80O14777 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDC80O14777 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDC80O14777 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDC80O14777 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDC80O14777 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDC80O14777 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDC80O14777 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NDC80O14777 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDC80O14777 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDC80O14777 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDC80O14777 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDC80O14777 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDC80O14777 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDC80O14777 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDC80O14777 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDC80O14777 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDC80O14777 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDC80O14777 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NDC80O14777 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDC80O14777 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDC80O14777 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDC80O14777 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDC80O14777 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDC80O14777 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDC80O14777 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDC80O14777 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDC80O14777 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDC80O14777 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDC80O14777 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDC80O14777 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NDC80O14777 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NDC80O14777 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NDC80O14777 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDC80O14777 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDC80O14777 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDC80O14777 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDC80O14777 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDC80O14777 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDC80O14777 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDC80O14777 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDC80O14777 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDC80O14777 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDC80O14777 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDC80O14777 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDC80O14777 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDC80O14777 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDC80O14777 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDC80O14777 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDC80O14777 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDC80O14777 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDC80O14777 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms