Protein–RNA interactions for Protein: O14593

RFXANK, DNA-binding protein RFXANK, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXANKO14593 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RFXANKO14593 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFXANKO14593 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RFXANKO14593 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RFXANKO14593 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RFXANKO14593 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RFXANKO14593 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFXANKO14593 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFXANKO14593 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFXANKO14593 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFXANKO14593 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFXANKO14593 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms