Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAFD1O14545 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAFD1O14545 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
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