Protein–RNA interactions for Protein: O00267

SUPT5H, Transcription elongation factor SPT5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT5HO00267 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
SUPT5HO00267 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
SUPT5HO00267 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
SUPT5HO00267 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
SUPT5HO00267 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
SUPT5HO00267 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC40.51■■■■■ 4.08
SUPT5HO00267 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
SUPT5HO00267 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
SUPT5HO00267 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
SUPT5HO00267 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
SUPT5HO00267 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
SUPT5HO00267 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
SUPT5HO00267 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
SUPT5HO00267 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
SUPT5HO00267 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
SUPT5HO00267 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
SUPT5HO00267 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
SUPT5HO00267 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
SUPT5HO00267 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
SUPT5HO00267 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
SUPT5HO00267 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
SUPT5HO00267 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
SUPT5HO00267 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
SUPT5HO00267 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
SUPT5HO00267 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
SUPT5HO00267 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
SUPT5HO00267 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
SUPT5HO00267 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
SUPT5HO00267 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.46■■■■■ 4.07
SUPT5HO00267 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
SUPT5HO00267 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC40.46■■■■■ 4.07
SUPT5HO00267 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
SUPT5HO00267 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
SUPT5HO00267 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
SUPT5HO00267 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
SUPT5HO00267 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC40.45■■■■■ 4.07
SUPT5HO00267 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
SUPT5HO00267 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
SUPT5HO00267 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
SUPT5HO00267 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
SUPT5HO00267 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
SUPT5HO00267 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
SUPT5HO00267 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
SUPT5HO00267 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
SUPT5HO00267 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
SUPT5HO00267 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
SUPT5HO00267 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
SUPT5HO00267 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
SUPT5HO00267 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
SUPT5HO00267 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
SUPT5HO00267 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
SUPT5HO00267 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
SUPT5HO00267 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
SUPT5HO00267 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
SUPT5HO00267 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
SUPT5HO00267 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
SUPT5HO00267 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
SUPT5HO00267 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
SUPT5HO00267 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
SUPT5HO00267 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
SUPT5HO00267 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
SUPT5HO00267 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
SUPT5HO00267 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
SUPT5HO00267 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
SUPT5HO00267 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
SUPT5HO00267 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
SUPT5HO00267 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
SUPT5HO00267 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
SUPT5HO00267 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
SUPT5HO00267 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
SUPT5HO00267 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC40.39■■■■■ 4.06
SUPT5HO00267 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
SUPT5HO00267 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
SUPT5HO00267 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
SUPT5HO00267 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
SUPT5HO00267 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
SUPT5HO00267 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
SUPT5HO00267 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
SUPT5HO00267 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
SUPT5HO00267 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
SUPT5HO00267 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
SUPT5HO00267 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
SUPT5HO00267 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
SUPT5HO00267 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
SUPT5HO00267 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
SUPT5HO00267 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
SUPT5HO00267 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
SUPT5HO00267 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
SUPT5HO00267 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
SUPT5HO00267 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
SUPT5HO00267 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
SUPT5HO00267 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
SUPT5HO00267 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
SUPT5HO00267 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
SUPT5HO00267 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
SUPT5HO00267 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
SUPT5HO00267 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
SUPT5HO00267 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
SUPT5HO00267 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC40.34■■■■■ 4.05
SUPT5HO00267 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC40.34■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms