Protein–RNA interactions for Protein: K7EIQ3

ZNF561-AS1, Uncharacterized protein ZNF561-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF561-AS1K7EIQ3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF561-AS1K7EIQ3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF561-AS1K7EIQ3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF561-AS1K7EIQ3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF561-AS1K7EIQ3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF561-AS1K7EIQ3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF561-AS1K7EIQ3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF561-AS1K7EIQ3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF561-AS1K7EIQ3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF561-AS1K7EIQ3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF561-AS1K7EIQ3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF561-AS1K7EIQ3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF561-AS1K7EIQ3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF561-AS1K7EIQ3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF561-AS1K7EIQ3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF561-AS1K7EIQ3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF561-AS1K7EIQ3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF561-AS1K7EIQ3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF561-AS1K7EIQ3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF561-AS1K7EIQ3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF561-AS1K7EIQ3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF561-AS1K7EIQ3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF561-AS1K7EIQ3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF561-AS1K7EIQ3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF561-AS1K7EIQ3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF561-AS1K7EIQ3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF561-AS1K7EIQ3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms