Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QKU1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QKU1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QKU1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QKU1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QKU1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QKU1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QKU1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QKU1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QKU1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QKU1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QKU1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QKU1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QKU1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QKU1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QKU1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3QKU1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3QKU1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3QKU1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
J3QKU1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3QKU1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3QKU1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3QKU1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3QKU1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3QKU1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3QKU1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3QKU1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3QKU1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3QKU1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3QKU1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3QKU1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3QKU1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3QKU1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3QKU1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3QKU1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
J3QKU1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
J3QKU1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3QKU1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3QKU1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QKU1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QKU1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QKU1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QKU1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QKU1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QKU1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QKU1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QKU1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QKU1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QKU1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QKU1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3QKU1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QKU1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QKU1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QKU1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QKU1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QKU1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QKU1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QKU1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QKU1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QKU1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QKU1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QKU1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QKU1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QKU1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QKU1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QKU1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QKU1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QKU1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QKU1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QKU1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QKU1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QKU1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QKU1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QKU1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QKU1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QKU1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QKU1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QKU1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QKU1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QKU1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QKU1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QKU1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QKU1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QKU1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QKU1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QKU1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QKU1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QKU1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QKU1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QKU1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QKU1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QKU1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QKU1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QKU1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QKU1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QKU1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QKU1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QKU1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QKU1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QKU1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms