Protein–RNA interactions for Protein: H7C2G1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C2G1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H7C2G1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H7C2G1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H7C2G1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H7C2G1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H7C2G1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H7C2G1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H7C2G1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H7C2G1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H7C2G1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H7C2G1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H7C2G1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H7C2G1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H7C2G1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H7C2G1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H7C2G1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H7C2G1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H7C2G1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H7C2G1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H7C2G1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H7C2G1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H7C2G1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H7C2G1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H7C2G1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H7C2G1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H7C2G1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H7C2G1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H7C2G1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H7C2G1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H7C2G1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H7C2G1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H7C2G1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H7C2G1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H7C2G1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H7C2G1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H7C2G1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H7C2G1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H7C2G1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H7C2G1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H7C2G1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H7C2G1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H7C2G1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H7C2G1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H7C2G1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H7C2G1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H7C2G1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H7C2G1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H7C2G1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H7C2G1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H7C2G1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H7C2G1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H7C2G1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H7C2G1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H7C2G1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H7C2G1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H7C2G1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H7C2G1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H7C2G1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H7C2G1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H7C2G1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C2G1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C2G1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C2G1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C2G1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C2G1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C2G1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C2G1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C2G1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C2G1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H7C2G1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C2G1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C2G1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C2G1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C2G1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C2G1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C2G1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C2G1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C2G1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C2G1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C2G1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C2G1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C2G1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C2G1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C2G1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C2G1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H7C2G1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H7C2G1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H7C2G1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H7C2G1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H7C2G1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H7C2G1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H7C2G1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H7C2G1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H7C2G1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H7C2G1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H7C2G1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H7C2G1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H7C2G1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H7C2G1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H7C2G1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms