Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
H7C1D1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
H7C1D1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
H7C1D1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
H7C1D1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
H7C1D1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
H7C1D1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
H7C1D1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
H7C1D1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
H7C1D1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
H7C1D1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
H7C1D1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
H7C1D1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
H7C1D1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
H7C1D1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
H7C1D1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
H7C1D1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
H7C1D1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
H7C1D1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
H7C1D1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
H7C1D1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
H7C1D1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
H7C1D1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
H7C1D1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
H7C1D1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
H7C1D1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
H7C1D1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
H7C1D1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
H7C1D1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
H7C1D1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
H7C1D1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
H7C1D1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
H7C1D1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
H7C1D1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
H7C1D1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
H7C1D1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
H7C1D1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
H7C1D1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
H7C1D1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
H7C1D1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
H7C1D1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
H7C1D1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
H7C1D1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
H7C1D1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
H7C1D1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
H7C1D1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
H7C1D1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
H7C1D1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
H7C1D1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
H7C1D1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
H7C1D1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
H7C1D1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
H7C1D1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
H7C1D1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
H7C1D1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
H7C1D1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
H7C1D1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
H7C1D1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
H7C1D1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
H7C1D1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
H7C1D1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
H7C1D1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
H7C1D1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
H7C1D1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
H7C1D1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
H7C1D1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
H7C1D1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
H7C1D1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
H7C1D1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
H7C1D1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
H7C1D1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
H7C1D1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
H7C1D1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
H7C1D1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
H7C1D1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
H7C1D1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
H7C1D1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
H7C1D1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
H7C1D1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
H7C1D1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
H7C1D1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
H7C1D1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
H7C1D1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
H7C1D1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
H7C1D1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
H7C1D1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
H7C1D1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
H7C1D1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
H7C1D1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
H7C1D1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
H7C1D1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
H7C1D1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
H7C1D1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
H7C1D1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
H7C1D1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
H7C1D1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
H7C1D1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
H7C1D1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
H7C1D1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
H7C1D1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms