Protein–RNA interactions for Protein: H3BQF6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQF6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BQF6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BQF6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BQF6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BQF6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BQF6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BQF6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BQF6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BQF6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BQF6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BQF6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BQF6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BQF6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BQF6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H3BQF6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
H3BQF6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
H3BQF6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H3BQF6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
H3BQF6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
H3BQF6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
H3BQF6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
H3BQF6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
H3BQF6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H3BQF6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H3BQF6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
H3BQF6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H3BQF6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H3BQF6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H3BQF6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H3BQF6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H3BQF6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H3BQF6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
H3BQF6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H3BQF6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H3BQF6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H3BQF6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H3BQF6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H3BQF6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H3BQF6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H3BQF6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H3BQF6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H3BQF6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H3BQF6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
H3BQF6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
H3BQF6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
H3BQF6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H3BQF6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H3BQF6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
H3BQF6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H3BQF6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3BQF6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3BQF6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3BQF6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3BQF6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3BQF6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3BQF6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3BQF6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3BQF6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3BQF6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3BQF6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3BQF6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H3BQF6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H3BQF6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H3BQF6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H3BQF6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H3BQF6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
H3BQF6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H3BQF6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H3BQF6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H3BQF6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H3BQF6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
H3BQF6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BQF6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BQF6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BQF6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BQF6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BQF6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BQF6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BQF6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BQF6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BQF6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BQF6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BQF6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BQF6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BQF6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BQF6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BQF6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BQF6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BQF6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BQF6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BQF6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BQF6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BQF6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BQF6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BQF6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BQF6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BQF6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H3BQF6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H3BQF6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H3BQF6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms