Protein–RNA interactions for Protein: H3BNH8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNH8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BNH8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BNH8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BNH8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BNH8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BNH8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BNH8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BNH8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BNH8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BNH8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BNH8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BNH8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BNH8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BNH8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BNH8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BNH8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BNH8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BNH8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BNH8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BNH8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BNH8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BNH8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BNH8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BNH8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BNH8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BNH8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BNH8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BNH8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BNH8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BNH8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BNH8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BNH8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BNH8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BNH8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BNH8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BNH8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BNH8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BNH8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BNH8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BNH8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BNH8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BNH8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BNH8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BNH8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BNH8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H3BNH8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
H3BNH8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H3BNH8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
H3BNH8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
H3BNH8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H3BNH8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H3BNH8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3BNH8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3BNH8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3BNH8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3BNH8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3BNH8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BNH8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BNH8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BNH8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BNH8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BNH8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BNH8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BNH8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BNH8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BNH8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BNH8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BNH8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BNH8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BNH8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BNH8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BNH8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BNH8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BNH8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BNH8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BNH8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BNH8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BNH8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BNH8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BNH8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BNH8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BNH8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BNH8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BNH8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BNH8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BNH8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BNH8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BNH8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BNH8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BNH8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BNH8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BNH8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BNH8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BNH8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BNH8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BNH8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BNH8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BNH8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BNH8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BNH8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms