Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
USP17L12C9JPN9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP17L12C9JPN9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
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