Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PATL2C9JE40 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PATL2C9JE40 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PATL2C9JE40 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms