Protein–RNA interactions for Protein: C9JCJ5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9JCJ5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9JCJ5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9JCJ5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9JCJ5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9JCJ5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9JCJ5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9JCJ5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9JCJ5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9JCJ5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9JCJ5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9JCJ5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9JCJ5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9JCJ5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C9JCJ5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9JCJ5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9JCJ5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9JCJ5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9JCJ5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9JCJ5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9JCJ5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9JCJ5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9JCJ5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9JCJ5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9JCJ5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9JCJ5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9JCJ5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9JCJ5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C9JCJ5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9JCJ5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9JCJ5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9JCJ5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9JCJ5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9JCJ5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9JCJ5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9JCJ5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9JCJ5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C9JCJ5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9JCJ5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9JCJ5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9JCJ5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9JCJ5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9JCJ5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9JCJ5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9JCJ5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9JCJ5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9JCJ5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9JCJ5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9JCJ5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9JCJ5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9JCJ5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9JCJ5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9JCJ5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9JCJ5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9JCJ5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9JCJ5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9JCJ5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9JCJ5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9JCJ5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9JCJ5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9JCJ5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9JCJ5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9JCJ5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9JCJ5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9JCJ5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9JCJ5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9JCJ5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9JCJ5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9JCJ5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9JCJ5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9JCJ5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9JCJ5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9JCJ5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9JCJ5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9JCJ5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9JCJ5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9JCJ5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9JCJ5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9JCJ5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9JCJ5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9JCJ5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9JCJ5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9JCJ5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9JCJ5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9JCJ5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9JCJ5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9JCJ5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9JCJ5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9JCJ5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9JCJ5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9JCJ5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9JCJ5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C9JCJ5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9JCJ5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9JCJ5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9JCJ5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9JCJ5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9JCJ5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C9JCJ5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C9JCJ5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9JCJ5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms