Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF879B4DU55 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF879B4DU55 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms