Protein–RNA interactions for Protein: B1APH4

ZNF487, Putative zinc finger protein 487, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF487B1APH4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF487B1APH4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF487B1APH4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF487B1APH4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF487B1APH4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF487B1APH4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF487B1APH4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF487B1APH4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF487B1APH4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF487B1APH4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF487B1APH4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF487B1APH4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF487B1APH4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF487B1APH4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF487B1APH4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF487B1APH4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF487B1APH4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF487B1APH4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF487B1APH4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF487B1APH4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF487B1APH4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF487B1APH4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF487B1APH4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF487B1APH4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF487B1APH4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF487B1APH4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF487B1APH4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF487B1APH4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF487B1APH4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF487B1APH4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF487B1APH4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF487B1APH4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF487B1APH4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF487B1APH4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF487B1APH4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF487B1APH4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF487B1APH4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF487B1APH4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF487B1APH4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms