Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BECN2A8MW95 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms