Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A8MVJ9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
A8MVJ9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A8MVJ9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A8MVJ9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A8MVJ9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A8MVJ9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A8MVJ9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A8MVJ9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.31■■□□□ 1
A8MVJ9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A8MVJ9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.31■■□□□ 1
A8MVJ9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A8MVJ9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A8MVJ9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A8MVJ9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A8MVJ9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
A8MVJ9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A8MVJ9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
A8MVJ9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A8MVJ9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A8MVJ9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A8MVJ9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.3■■□□□ 1
A8MVJ9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
A8MVJ9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
A8MVJ9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A8MVJ9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A8MVJ9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
A8MVJ9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
A8MVJ9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A8MVJ9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A8MVJ9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A8MVJ9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
A8MVJ9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.29■■□□□ 1
A8MVJ9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.29■■□□□ 1
A8MVJ9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.29■■□□□ 1
A8MVJ9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.29■■□□□ 1
A8MVJ9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
A8MVJ9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
A8MVJ9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A8MVJ9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
A8MVJ9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
A8MVJ9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A8MVJ9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
A8MVJ9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A8MVJ9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A8MVJ9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A8MVJ9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A8MVJ9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
A8MVJ9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
A8MVJ9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A8MVJ9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
A8MVJ9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A8MVJ9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
A8MVJ9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A8MVJ9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A8MVJ9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A8MVJ9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A8MVJ9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A8MVJ9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A8MVJ9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A8MVJ9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A8MVJ9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A8MVJ9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MVJ9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MVJ9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MVJ9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MVJ9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MVJ9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MVJ9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MVJ9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MVJ9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MVJ9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MVJ9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MVJ9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MVJ9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MVJ9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MVJ9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MVJ9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MVJ9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MVJ9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MVJ9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MVJ9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MVJ9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MVJ9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MVJ9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MVJ9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MVJ9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MVJ9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MVJ9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MVJ9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MVJ9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MVJ9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A8MVJ9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A8MVJ9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A8MVJ9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A8MVJ9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
A8MVJ9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A8MVJ9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A8MVJ9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A8MVJ9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms