Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NOTOA8MTQ0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NOTOA8MTQ0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms