Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYSRT1A8MQ03 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYSRT1A8MQ03 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 264.1 ms