Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC169A6NNP5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC169A6NNP5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms