Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC85CA6NKD9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC85CA6NKD9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC85CA6NKD9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms