Protein–RNA interactions for Protein: A6NIX2

WTIP, Wilms tumor protein 1-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WTIPA6NIX2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
WTIPA6NIX2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
WTIPA6NIX2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
WTIPA6NIX2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
WTIPA6NIX2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
WTIPA6NIX2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
WTIPA6NIX2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
WTIPA6NIX2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
WTIPA6NIX2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
WTIPA6NIX2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
WTIPA6NIX2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
WTIPA6NIX2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
WTIPA6NIX2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
WTIPA6NIX2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
WTIPA6NIX2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
WTIPA6NIX2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
WTIPA6NIX2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
WTIPA6NIX2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
WTIPA6NIX2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
WTIPA6NIX2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
WTIPA6NIX2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
WTIPA6NIX2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
WTIPA6NIX2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
WTIPA6NIX2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
WTIPA6NIX2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
WTIPA6NIX2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
WTIPA6NIX2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
WTIPA6NIX2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
WTIPA6NIX2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
WTIPA6NIX2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
WTIPA6NIX2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
WTIPA6NIX2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
WTIPA6NIX2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
WTIPA6NIX2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
WTIPA6NIX2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms