Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY7

SDHAF1, Succinate dehydrogenase assembly factor 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF1A6NFY7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SDHAF1A6NFY7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF1A6NFY7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF1A6NFY7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF1A6NFY7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF1A6NFY7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF1A6NFY7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF1A6NFY7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF1A6NFY7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF1A6NFY7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF1A6NFY7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF1A6NFY7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF1A6NFY7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms