Protein–RNA interactions for Protein: A6NDY0

PABPN1L, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPN1LA6NDY0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPN1LA6NDY0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PABPN1LA6NDY0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PABPN1LA6NDY0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms