Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6BA6NDN3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6BA6NDN3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms