Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GMNCA6NCL1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GMNCA6NCL1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms