Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VWA8A3KMH1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms