Protein–RNA interactions for Protein: A0PJW6

TMEM223, Transmembrane protein 223, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM223A0PJW6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM223A0PJW6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms