Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVM2

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVM2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1B0GVM2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A1B0GVM2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A1B0GVM2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A1B0GVM2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1B0GVM2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1B0GVM2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1B0GVM2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1B0GVM2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1B0GVM2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms