Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J2C4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J2C4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A0A0B4J2C4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0B4J2C4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0B4J2C4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0B4J2C4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0B4J2C4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0B4J2C4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC15.08■□□□□ 0
A0A0B4J2C4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0B4J2C4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0B4J2C4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0B4J2C4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0B4J2C4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0B4J2C4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J2C4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J2C4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J2C4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J2C4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J2C4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J2C4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J2C4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J2C4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J2C4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J2C4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J2C4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J2C4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J2C4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0B4J2C4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0B4J2C4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0B4J2C4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0B4J2C4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0B4J2C4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0B4J2C4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0B4J2C4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0B4J2C4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0B4J2C4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0B4J2C4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0B4J2C4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0B4J2C4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A0A0B4J2C4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
A0A0B4J2C4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms