Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYC8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0A6YYC8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0A6YYC8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
A0A0A6YYC8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0A6YYC8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0A6YYC8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0A6YYC8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0A6YYC8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0A6YYC8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0A6YYC8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0A6YYC8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0A6YYC8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0A6YYC8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0A6YYC8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0A6YYC8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0A6YYC8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0A6YYC8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0A6YYC8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0A6YYC8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0A6YYC8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0A6YYC8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0A6YYC8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0A6YYC8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0A6YYC8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0A6YYC8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0A6YYC8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0A6YYC8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.31■■□□□ 1
A0A0A6YYC8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0A6YYC8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0A6YYC8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms