Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms