Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

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Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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HDGFL3Q9Y3E1 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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HDGFL3Q9Y3E1 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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HDGFL3Q9Y3E1 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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HDGFL3Q9Y3E1 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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HDGFL3Q9Y3E1 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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HDGFL3Q9Y3E1 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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