Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF8Q9UPP1 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms