Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 FAM230B-208ENST00000451257 3566 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 MYO1C-202ENST00000361007 4734 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 LRFN5-201ENST00000298119 3723 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 JDP2-203ENST00000435893 5401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 NPAP1-201ENST00000329468 7526 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 NLRP7-201ENST00000328092 3299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 MBNL1-AS1-202ENST00000608395 6585 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SMIM3Q9BZL3 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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