Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms