Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms